课题组组长：殷晓浦
课题组成员：金华南 卫秋慧 马孝霞 胡添源 谌容
课题组长简介：
主要从事天然产物代谢调控及生物合成等方面的研究。主持国家及省市级项目十余项，参与“十一五”重大新药创制专项，浙江省科技厅重点项目及杭州市科技局重大项目等，在CELL子刊Trends in Biotechnology、Bioresource Technology等知名期刊上发表SCI论文三十余篇。荣获2018年教育部科技进步一等奖（排名第3），2019年国家科技进步二等奖（排名第5），指导学生获第八届中国国际互联网+大学生创新创业大赛金奖，获浙江省高等学校教学成果二等奖。授权专利10余项。浙江省“浙产中药材资源开发与应用”工程研究中心副主任，中国中医药信息学会临床药学分会理事，国家自然科学基金评审专家，教育部学位论文评审专家，杭州市高层次人才C类。
课题组研究领域：
1. 合成生物学元件挖掘、改造及天然产物的高产细胞工厂构建
2. 道地药材组培、种质改良及活性成分生物合成途径解析
课题组科研成果：
国家级科研项目:
1.国家自然科学基金面上项目：非经典倍半萜烯底盘菌的从头构建、优化及在β-榄香烯同系物生物合成的研究，（82173919），2022.01 -2025.12
2.国家自然科学基金青年项目：雷公藤倍半萜生物碱母核形成的关键酶基因挖掘及其功能研究（82104320），2022.01-2024.12
3.国家自然科学基金面上项目：RNA降解组“差减法”测序技术解析拟南芥中非poly(A)尾转录本的转录后调控、加工信号及相关分子机制（32070655），2021.01 -2024.12
4.国家自然科学基金青年项目：CwJAZ6响应茉莉酸信号调控温郁金β-榄香烯生物合成的分子机制研究（81903742），2020.01-2022.12
5.国家自然科学基金青年项目：抗癌药物榄香烯生物合成关键倍半萜合酶基因的克隆、改造和功能研究（21606062），2017.01-2019.12
6.国家自然科学基金青年项目：拟南芥根系发育相关长链非编码RNA的系统挖掘及调控机制研究（31601062），2017.01-2019.12
7.国家十三五重点研发计划：小麦等作物功能基因组研究与应用，子任务大豆营养物质功能基因组学研究，2016.01-2020.12
8.国家自然科学基金青年项目：“普利类药物手性中间体的硅替代生物合成研究”（21006018），2011.01-2013.12
省市级科研项目：
1、 浙江省自然科学基金面上项目，穿心莲内酯类手性胺候选药物的高产酵母细胞工厂构建研究（LY24H280006），2024.1-2026.12
1、浙江省自然科学基金青年项目：β-榄香烯关键前体吉玛烯A高效合成元件的挖掘与改造研究（LQ22H280013），2022.01-2024.12
2、浙江省自然科学基金青年项目：“浙八味”道地药材温郁金的高产多抗新品种创制研究（LQ19C020002），2019.01-2021.12
3、浙江省自然科学基金青年项目：LncRNAs在拟南芥根系中的组织特异表达模式及其根发育相关调控机制的研究（LQ16C060003），2016.01-2018.01
4、杭州市科技局项目：MicroRNA在农作物生长发育过程中养分、激素、胁迫信号互作中的调控作用研究（20170432B04），2017.01-2018.12
5、浙江省自然科学基金面上项目：抗癌新药β-榄香烯生物合成途径中的关键酶的分子改造（LY15B060012），2015.01-2017.12
6、浙江省自然科学基金青年项目：青蒿素生物合成途径上相关酶DBR2和ALDH1的功能研究（LQ15C020003），2015.01-2017.12
7、杭州市科技局重大科技创新专项：基于分子生物技术提高浙八味温郁金抗癌活性成分 榄香烯含量的品种改良选育研究（20142013A63），2014.01-2017.12
8、湖北省科学自然基金：大豆皂苷的合成调控以及合成皂苷后修饰酶，2014.01-2015.12
9、浙江省科技厅公益类项目：生物催化法生产(R)/(S)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯的工艺研究（2009C31086），2009.01-2012.12
10、杭州市科技局重大科技创新专项：基于酶库构建的重磅药物酶法绿色化学工艺开发（20092113A03），2009.1-2012.12
代表性论文：
1 Chen R.*, Wang M., Keasling Jay D., Hu T.,Yin X.*, Expanding the structural diversity of terpenes by synthetic biology approaches, Trends in Biotechnology, 2024, 2447:115.（Cell子刊，中科院一区TOP期刊，近5年平均影响因子18.2）
2 Liu, Y., Wu, S., Lan, K., Wang, Q., Ye, T., Jin, H., Hu, T., Xie, T., Wei, Q.*, Yin, X.*, An Investigation of the JAZ Family and the CwMYC2-like Protein to Reveal Their Regulation Roles in the MeJA Induced Biosynthesis of β-Elemene in Curcuma wenyujin. International Journal of Molecular Sciences, 2023, 24:15004.（JCR一区）
3 Chen R., Liu Yu., Chen S., Wang M., Zhu Y., Hu T., Wei Q., Yin X.*, Xie T.*, Protein engineering of a germacrene A synthase from Lactuca sativa and its application in high productivity of germacrene A in Escherichia coli, Frontiers in Plant Science, 2022, 13:932966.（JCR一区）
4 Chen R., Hu T., Wang M., Hu Y., Chen S., Wei Q., Yin X.*, Xie T.*, Functional characterization of key polyketide synthases by integrated metabolome and transcriptome analysis on curcuminoid biosynthesis in Curcuma wenyujin, Synthetic and Systems Biotechnology, 2022, 7(3): 849-861.（JCR一区）
5 Wei Q. *, Liu Y., Lan K., Wei X., Hu T., Chen R., Zhao S., Yin X. *, Xie T.*, Identification and Analysis of MYB Gene Family for Discovering Potential Regulators Responding to Abiotic Stresses in Curcuma wenyujin. Frontiers in Genetics, 2022, 13:894928.
6 Wei Q. *, Lan K., Liu Y.,Chen R., Zhao S., Yin X. *, Xie T.*, Transcriptome analysis reveals regulation mechanism of methyl jasmonate-induced terpenes biosynthesis in Curcuma wenyujin, Plos One, 2022, 17(6):e0270309.
7 Chen R., Wei Q., Liu Yu., Wei X., Chen X.,Yin X.*, Xie T.*, Transcriptome sequencing and functional characterization of new sesquiterpene synthases from Curcuma wenyujin, Archives of Biochemistry and Biophysics, 2021, 709: 108986.
8 Ma X.#, Yin X.#, Tang Z., Ito H., Shao C., Meng Y., Xie T.*, The RNA degradome: a precious resource for deciphering RNA processing and regulation codes in plants, RNA Biology, 2020, 17(9): 1223-1227.
9 Wei Q.*, Chen R., Wei X., Liu Yu., Zhao S.,Yin X.*, Xie T.*, Genome-wide identification of R2R3-MYB family in wheat and functional characteristics of the abiotic stress responsive gene TaMYB344, BMC Genomics, 2020, 21(1): 792.
10. Ma X., Meng Y., Wang P., Tang Z., Wang H., Xie T., Bioinformatics-assisted,integrated omics studies on medicinal plants. Brief in Bioinfor, 2020, 21(6), 1857-1874. (中科院一区TOP)
11.Chen R., Wei Q., Wei X., Liu Y., Zhang X., Chen X.,Yin X., Xie T., Stable and efficient immobilization of bi-enzymatic NADPH cofactor recycling system under consecutive microwave irradiation. PLOS ONE, 2020, 15(11): e0242564.
12.Wei Q., Chen R., Wei X., Liu Y., Zhao S., Yin X. , Xie T., Genome-wide identification of R2R3-MYB family in wheat and functional characteristics of the abiotic stress responsive gene TaMYB344. BMC Genomics, 2020, 21:792.
13.Ma X., Yin X., Tang Z., Ito H., Shao C., Meng Y., Xie T. , The RNA degradome: a precious resource for deciphering RNA processing and regulation codes in plants. RNA Biol, 2020, 17(9):1223-1227.
14.Hu T., Zhou J., Tong Y., Su P., Li X., Liu Y., Liu N., Wu X., Zhang Y., Wang J., Gao L., Tu L., Lu Y., Jiang Z., Zhou J., Gao W., Huang L., Engineering chimeric diterpene synthases and isoprenoid biosynthetic pathways enables high-level production of miltiradiene in yeast. Metab Eng, 2020, 60:87-96.
15.Ma X., Yu D., Shao W., Xu M., Zuo Z., Wang H., M., Transcriptome-wide identification and characterization of the copper and cadmium stress-responsive small RNAs and their targets in Arabidopsis thaliana. Plant and Soil, 2018, 429:391-405.
16.Ma X., Zuo Z., Shao W., Jin Y., Meng Y.. The expanding roles of Argonautes: RNA interference, splicing and beyond. Brief Funct Genomics, 2017, 17(3): 191-197.
17.胡添源, 王睿, 陈上, 马宝伟, 高伟, 黄璐琦. 雷公藤悬浮细胞原生质体的制备及瞬时转化体系的建立. 植物学报, 2017, 52 (6): 774-782.
18.Wei Q., Zhang F., Sun F., Luo Q., Wang R., Hu R., Chen M.,Chang J., Yang G., He G., A wheat MYB transcriptional repressor TaMyb1D regulates phenylpropanoid metabolism and enhances tolerance to drought and oxidative stresses in transgenic tobacco plants. Plant Sci, 2017, 112-123.
19.Wei Q., Luo Q., Wang R., Zhang F., He Y., Zhang Y., Qiu D., Li K.,Chang J., Yang G., He G., A wheat R2R3-type MYB transcription factor TaODORANT1 positively regulates drought and salt stress responses in transgenic tobacco plants. Front Plant Sci, 2017, 8:1374.
20.Luo Q., Wei Q., Wang R., Zhang Y., Zhang F., He Y., Zhou S., Feng J., Yang G., He G., BdCIPK31, a Calcineurin B-like protein-interacting protein kinase, regulates plant response to drought and salt stress. Front Plant Sci, 2017, 8:1184.
21.胡添源, 苏平, 张逸风, 关红雨, 周家伟, 童宇茹, 高伟, 黄璐琦. 雷公藤单萜合酶基因TwMS的克隆及蛋白表达分析. 中国中药杂志, 2017, 42(7): 1312-1318. （中国科技期刊卓越行动计划入选项目）
22.Zhang F., Wei Q., Shi J., Jin X., He Y., Zhang Y., Luo Q., Wang Y., Chang J., Yang G., He G., BdPP2CA6 interacts with BdPYLs and BdSnRK2 and positively regulates salt tolerance in transgenic Arabidopsis. Front Plant Sci, 2017, 8:264.
23.Su P., Hu T., Liu Y., Tong Y., Guan H., Zhang Y., Zhou J., Huang L., Gao W., Functional characterization of NES and GES responsible for the biosynthesis of (E)-nerolidol and (E, E)-geranyllinalool in Tripterygium wilfordii. Sci Rep, 2017, 7:40851.
24.胡添源, 高伟, 黄璐琦. 展望CRISPR/Cas9 基因编辑技术在药用植物研究中的应用.中国中药杂志, 2016, 41(16):2953-2957. （中国科技期刊卓越行动计划入选项目）
25.Ma X., Tang Z., Qin J., Meng Y., The use of high-throughput sequencing methods for plant microRNA research. RNA Biol, 2015, 12(7): 709-719.
26.Wang Q., Ye T., Ma Z., Chen R., Xie T., Yin X., Characterization and site-directed mutation of a novel aldo–keto reductase from Lodderomyces elongisporus NRRL YB-4239 with high production rate of ethyl (R)-4-chloro-3-hydroxybutanoate，J Ind Microbio Biot，2014, 41(11):1609-1616.
27.Wang Q., Shen L., Ye T., Cao D., Chen R., Pei X., Xie, T., Li Yan., Gong W., Yin X., Overexpression and characterization of a novel (S)-specific extended short-chain dehydrogenase/reductase from Candida parapsilosis, Bioresour Technol, 2012, 123: 690-694.（中科院一区TOP）
专利：
1、一种温郁金胚性愈伤组织诱导与植株再生方法，专利号2020105229421，已授权。
2、一种α-愈创木烯合成酶、基因及应用，专利号2021104362571，已授权。
3、一种α-檀香烯合成酶、基因及应用，专利号2021104362618，已授权。
4、一种温郁金来源的姜黄素合成酶、基因、载体、工程菌及应用，专利申请号202210405041.3。
5、一种产β-榄香烯的工程菌及其应用，专利申请号202210818797.0。
6、 一种紫茎泽兰来源的倍半萜合酶、基因、载体、工程菌及其应用，授权专利号：201610960527.8（已转化）
7、一种温郁金来源的倍半萜合酶、基因、载体、工程菌及其应用，授权专利号：201610867872.7（已转化）
8、一种醛酮还原酶和葡萄糖脱氢酶的微波辅助共固定化方法，授权专利号：2015103505731
9、一种醛酮还原酶和葡萄糖脱氢酶的包埋共固定化方法，授权专利号：2015103511605
10、酮还原酶LEK、编码基因、突变体及应用，授权专利号：2013102453463
11、酮还原酶LEK突变体及应用，授权专利号：201310244684.5
奖项：
1. 项目“新型稀缺酶资源研发体系创建及其在医药领域应用”获2018年教育部科技进步一等奖（2018-220），第一完成单位杭州师范大学。
2. 项目“新型稀缺酶资源研发体系创建及其在医药领域应用”获2019年国家科技进步二等奖，第一完成单位杭州师范大学。
3. 第八届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛金奖，证书编号202320022
4. 第八届浙江省国际“互联网+”大学生创新创业大赛金奖
5. 2021年度浙江省高等教育教学成果二等奖，证书编号2021GJ176
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