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陶林课题组
来源:药学院|日期:2020-12-16|点击:2691
 

课题组长:陶林

课题组成员:博士研究生吴萼


课题组长简介:

陶林,博士,毕业于新加坡国立大学综合科学与工程研究生院。浙江省高校“钱江学者”特聘教授,浙江省151人才工程第一层次。早期主要从事基因组数据分析工作,分别参与了中国杂交水稻基因组框架图和日本血吸虫基因组框架图分析工作。由于在“中国杂交水稻基因组项目”中的突出贡献,被授予2003年度中国科学院杰出科技成就奖(荣誉)。近几年研究方向主要集中在药物和天然产物信息学,作为项目主要成员参与开发了多个药物研发相关数据库,网站服务器和基于机器学习方法的预测模型,同时基于这些数据和方法,系统分析并首次发现了天然产物药物在物种空间和化学空间的分布规律,研究了天然产物特别是先导化合物的优缺点以及优化的规律,以期为新药来源,鉴别和优化提供重要线索。已在相关学科国际期刊发表论文30余篇,其中以第一作者或通讯作者(包含共同)在包括Nature Biotechnology, Advanced Drug Delivery Reviews, Nucleic Acids Research等著名杂志发表论文13篇。


课题组研究领域:

生物信息学、药物与天然产物信息学、计算机辅助药物设计、人工智能机器学习应用


课题组科研成果:

代表性论文:

1、Tao L, Zhu F, Qin C, Zhang C, Xu F, Tan CY, Jiang YY*, Chen YZ*. Nature’s contribution to today’s pharmacopeia. Nature Biotechnology 32, 979-980 (2014).

2、Tao L, Zhu F, Qin C, Zhang C, Chen SY, Zhang P, Zhang CL, Tan CY, Gao CM, Chen Z, Jiang YY, Chen YZ. Clustered Distribution of Natural Product Leads of Drugs in the Chemical Space as Influenced by the Privileged Target-Sites. Scientific Reports 5, 9325 (2015). 

3、Tao L, Zhu F, Xu F, Chen Z, Jiang YY*, Chen YZ*. Co-Targeting Cancer Drug Escape Pathways Confers Clinical Advantage for Multi-Target Anticancer Drugs. Pharmacological Research 102, 123-131 (2015).

4、Hong Jiajun#, Luo Yongchao#, Zhang Yang, Ying Junbiao, Xue Weiwei, Xie Tian, Tao L*, Zhu F*. Protein functional annotation of simultaneously improved stability, accuracy and false discovery rate achieved by a sequence-based deep learning. Briefings in Bioinformatics. 21(4):1437-1447 (2020).

5、Tao L, Zhang P, Qin C, Chen SY, Zhang C, Chen Z, Yang SY, Zhu F, Wei YQ, Chen YZ. Recent progress in the exploration of machine earning methods as in-silico ADME prediction tools. Advanced Drug Delivery Reviews 86, 83-100 (2015).


联系方式:

15967119884/taolin@hznu.edu.cn