一、导师基本情况
姓名:陶林,哲学博士,研究员(硕士生导师)
邮箱:taolin@hznu.edu.cn.
指导专业:药学
二、研究领域
1. 计算机辅助药物设计
2. 天然产物/药物信息学
3. 机器学习药物领域应用
4. 生物信息学
三、主讲课程
1. 生物信息学与新药研发
四、教育和工作经历
1997年9月--2001年6月,浙江大学,理学学士
2001年1月--2005年3月,杭州华大基因,项目组长
2005年3月--2009年7月,上海生物信息学研究中心,科研骨干
2009年8月--2014年8月,新加坡国立大学综合科学与工程研究生院,哲学博士
2013年8月—2016年9月,新加坡国立大学药学院,助理研究员
2016年9月,杭州师范大学药学院,研究员
五、学术简介(限200字内)
浙江省高校“钱江学者”特聘教授,浙江省151人才工程一层次。研究方向为药物/天然产物信息学,参与开发了多个药物研发相关数据库,网站服务器和基于机器学习方法的预测模型,同时基于这些数据和方法,系统分析并首次发现了天然产物药物在物种空间和化学空间的分布规律,研究了天然产物特别是先导化合物的优缺点以及优化的规律,以期为新药来源,鉴别和优化提供重要线索。已在相关学科包括Nature Biotechnology, Advanced Drug Delivery Reviews, Nucleic Acids Research等期刊发表论文30余篇。
六、主持教学科研项目(省部级以上)
七、代表性论著
1. Hong Jiajun, Luo Yongchao, Zhang Yang, Ying Junbiao, Xue Weiwei, Xie Tian, Tao L*, Zhu F*. Protein functional annotation of simultaneously improved stability, accuracy and false discovery rate achieved by a sequence-based deep learning. Briefings in Bioinformatics 2020. 21(4):1437-1447.
2. Zeng X*, Tao L*, Peng Z, Qin C, Chen S, He W, Tan Y, Xia Liu H, Yang SY, Chen Z, Jiang YY, Chen YZ. HEROD: a human ethnic and regional specific omics database. Bioinformatics 2017. 33 (20), 3276-3282.
3. Tao L, Zhu F, Xu F, Jiang YY, Chen YZ. Co-Targeting Cancer Drug Escape Pathways Confers Clinical Advantage for Multi-Target Anticancer Drugs. Pharmacological Research 202 2015. 123-131.
4. Tao L, Zhu F, Qin C, Zhang C, Chen SY, Zhang P, Zhang CL, Tan CY, Gao CM, Chen Z, Jiang YY, Chen YZ. Clustered Distribution of Natural Product Leads of Drugs in the Chemical Space as Influenced by the Privileged Target-Sites. Scientific Reports 5 2015. 9325.
5. Tao L, Zhu F, Qin C, Zhang C, Xu F, Tan CY, Jiang YY, Chen YZ. Nature’s contribution to today’s pharmacopeia. Nature Biotechnology 32 2014. 979-980 .