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陈侠斌课题组
来源:药学院|日期:2020-12-30|点击:8417
 

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课题组长:陈侠斌 教授

课题组成员:侯书荣、童骏森、邱婷、林英英、王大明

课题组长简介

陈侠斌,教授,美国肯塔基大学药学博士,微生物与生化药学教研室主任。在PNAS, Angew Chem Int, Clin Cancer Res, Org Lett, Acs Chem Biol, Mol Pharm等知名期刊发表sci论文30余篇;主持和参与国家自然科学基金、美国国立卫生研究所基金等项目12项;获2019年国家科学技术进步奖二等奖(排名第三)、2018年教育部科技进步奖一等奖(排名第六)、2016年国家优秀留学生奖、2015年美国药学科学家协会研究生生物技术奖(全球每年4位获奖者);入选浙江省级人才,杭州市省级领军人才(C类)。担任国家科学技术奖励评审专家,“annals of translational medicine”杂志编委,中国抗癌协会中西医整合肿瘤专业委员会委员,美国药学科学家协会会员。

课题组成员简介:

侯书荣,副教授,2010年1月-2014年8月就读于美国肯塔基大学,获得药学博士学位;2015年3月-2018年8月就职于美国Scripps研究所,从事博士后研究工作;2018年9月加入杭州师范大学药学院。主要从事新药(抗癌)研发和蛋白药物的功能改造方面的研究,在Angew. Chem. Int. Ed、Oncogene、J Nanobiotechnology、PNAS、Nat Commun等知名期刊发表SCI论文30余篇;主持和参与国家自然科学基金、杭州市高层次留学回国人员创业创新项目、美国国立卫生研究所基金等项目7项;获批美国专利4项,申请中国专利2项;参与项目获2019年国家科学技术进步奖二等奖和2018年教育部科技进步奖一等奖。

童骏森,副教授,韩国全南国立大学药学院药学博士,杭州师范大学卓越人才第五层次。长期从事蛋白质结构与功能关系研究,包括酶与底物的相互作用,蛋白酶改造,靶向蛋白质的药物设计等研究方向。运用蛋白质晶体学、生物化学、细胞生物学等研究方法来阐明蛋白-蛋白或蛋白-配体相互作用的分子机制,在PNAS, Nat Commun, Structure, BBA等知名期刊发表SCI论文10余篇,总影响因子超过40。主持国家自然科学基金一项,杭州市高层次留学回国人员创业创新项目一项,横向课题2项。

邱婷,特聘副教授,浙江大学遗传学博士,2020年7月加入杭州师范大学药学院,主要从事癌症相关蛋白质相变研究工作,探究蛋白质相变发生机制、蛋白质相变发生与癌症发生发展的关系以及基于相变蛋白的药物设计与研发。主持国家自然科学基金1项、浙江省自然科学基金1项,参与国家自然科学基金2项。


林英英,特聘副教授,厦门大学药学院化学生物学博士。2019年毕业后进入Abcam杭州生产研发总部,任MST科学家,于2021年12月被杭州师范大学以卓越人才引进。主要从事多组学(包括但不限于蛋白质组学,转录组学,表观遗传学)结合探究药物在疾病发生发展过程中的作用机理,发现药物作用靶点,开发新型药物。在Molecular cell,Frontiers in immunology,iScience, Journal of molecular cell biology等知名国际期刊上发表多篇文章,总计影响因子超过40分,主持国家自然科学基金一项,杭州师范大学“卓越人才计划”项目一项。


王大明,特聘副教授,江南大学发酵工程博士,主要从事微生物代谢工程和合成生物学强化微生物合成植物天然产物等相关研究。主持杭州师范大学“卓越人才计划”项目1项,主持完成中国博士后科学基金面上项目1项、江苏省博士后科学基金面上项目1项,参与国家自然科学基金、863计划课题、国家微生物制造专项等科研项目7项。在国内外学术期刊发表论文10余篇,授权国家发明专利1项。相关工作有效提高了多种维生素类发酵产品的工业用菌生产性能。


课题组研究领域:

1)基于结构生物学-计算机辅助设计的酶改造

酶是重要的生物催化元件,是生物制造的“芯片”,同时在药物滥用、肿瘤、糖尿病等重大疾病的诊断和治疗中起重要作用。酶的改造并提高其催化活性是公认的科学挑战。课题组集成结构生物学和计算化学,研究蛋白结构与功能的关系,构建酶-底物结合模型,结合QM/MM研究方法,深入阐明酶催化机制,并合理化设计突变体,提升酶的催化效率、稳定性和底物特异性,为医药用酶开发提供了新理论、新思路和新方法。

2)基于高通量药物筛选-计算机辅助设计-人工智能的新药发现及配伍

高通量药物筛选结合计算机药物设计以及当今大放异彩的人工智能技术,用于药物靶点发现、新药设计、药物筛选和药物优化的新药研发体系,大大加速创新药物的发现。课题组围绕危害人类健康的重大疾病如恶性肿瘤、心脑血管疾病等,针对生物靶点或疾病表型建立高通量药物筛选及计算机虚拟筛选方法研发创新药物及配伍复合新药,促进生命科学与医药科学研究成果的快速转化。

3) 蛋白质相变与疾病发生发展关系的探究

近年来,有关生物大分子通过“液-液”相分离(也称相变)机制进行功能调控的研究发展迅速。相变产生的生物分子凝聚体在众多细胞生命活动中发挥关键作用,许多疾病特别是神经退行性疾病的一个典型特征是相关致病蛋白的聚集,如阿尔兹海默症、渐冻症(ALS)等,相变的研究为这些疾病机制的探究提供了新的思路。课题组与西湖大学合作,围绕蛋白质相变开展工作,探究相变发生的物理化学本质,研究蛋白质相变的发生在疾病发生发展过程中的作用机制,进而设计针对蛋白质相变发生的特异性药物,用于疾病的治疗。

4)基于多组学研究药物作用机制

结合多组学包括蛋白质组学、转录组学、表观遗传学、代谢组学等手段研究药物的作用机理,发现药物作用靶点,进而进行针对性的高通量药物筛选并开展相应的细胞与动物模型验证,开发新型药物。

5)微生物代谢工程和合成生物学强化微生物合成植物天然产物等相关研究

主要包括:医药、保健食品、营养化学品相关的高附加值天然产物的绿色生物制造;工业用菌种质资源的开发与利用;新型工业用酶和关键酶的挖掘、理性设计与定向进化;工业微生物代谢途径的调控机制解析与代谢工程改造。

科研项目:

1. 国自然面上项目(2021-2024):外源性苯甲酰牙子碱代谢酶的首次发现与合理化设计及其催化机制研究,主持人:陈侠斌

2. 国自然青年项目(2019-2021):苯甲酰芽子碱水解酶的设计制备及活性评价,主持人:陈侠斌

3. 浙江省“钱江人才计划”项目(2020-2022):丁酰胆碱酯酶的理性设计改造并用于可卡因中毒治疗,主持人:陈侠斌

4. 高层次留学回国人员(团队)在杭创业创新项目(2020-2022):用于成瘾治疗的长效可卡因水解酶开发,主持人:陈侠斌

5. 企业合作项目(2019-2021):贴壁细胞在人工半月板材料生长条件的优化及特征,主持人:陈侠斌

6. 杭州师范大学“卓越人才计划”项目(2018-2021):基于计算机辅助设计蛋白药物的发现与改造,主持人:陈侠斌

7. 国自然青年项目(2020-2022):榄香烯增敏蛋白酶体抑制剂硼替佐米抗胰腺癌的作用及其分子机制研究,主持人:侯书荣

8. 杭州师范大学“卓越人才计划”项目(2018-2021):基于高通量筛选的榄香烯联合用药开发用于胰腺癌治疗,主持人:侯书荣

9. 高层次留学回国人员在杭创新创业项目(2022-2024):基于浙八味温郁金抗癌天然药物榄香烯分子配伍治疗胰腺癌新药研发,主持人:侯书荣

10. 国家自然科学基金(2021-2023):拟南芥SAUR41s亚家族蛋白通过相变调控盐胁迫响应的机制研究,主持人:邱婷

11. 浙江省自然科学基金(2021-2023):拟南芥SAUR41s通过相变参与细胞壁形成调控细胞膨大的机理研究,主持人:邱婷

12. 杭州师范大学“卓越人才计划”项目(2019-2022):脂肪酸代谢硫酯酶晶体结构解析及选择性研究,主持人:童骏森

13. 国家自然科学基金(2022-2024):茉莉酸甲基转移酶代谢除草剂2,4-D的分子机制和理性改造,主持人:童骏森

14. 高层次留学回国人员(团队)在杭创业创新项目(2022-2024):玉米脂肪酸调控关键硫酯酶的设计重构,主持人:童骏森

15. 国家自然科学基金(2022-2024):PRRC2在eIF3调控的翻译过程中的分子机制及其对肌肉健康的影响,主持人:林英英

16. 杭州师范大学“卓越人才计划”项目(2021-2025):PRRC2在eIF3调控的翻译过程中的作用,主持人:林英英

17. 杭州师范大学“卓越人才计划”项目(2021-2025):抗癌天然药物榄香烯等的绿色生物制造,主持人:王大明

代表性论文:

1. Computational Design and Crystal Structure of a Highly Efficient Benzoylecgonine Hydrolase. Angew. Chem. Int. Ed. 2021, 60(40): 21959-21965

2. Precision 3D printed meniscus scaffolds to facilitate hMSCs proliferation and chondrogenic differentiation for tissue regeneration. J Nanobiotechnology, 2021, 19(1):400

3. Chartspiroton, a Tetracyclic Spiro-naphthoquinone Derivative from a Medicinal Plant Endophytic Streptomyces. Org Lett, 2020, 22(10):3739-3743.

4. Evaluation of the cholinesterase activity of a potential therapeutic cocaine esterase for cocaine overdose. Drug Alcohol Depend, 2019, 202:168-171.

5. Long-acting cocaine hydrolase for addiction therapy. Proc Natl Acad Sci USA, 2016, 113(2):422-7.

6. A Novel Three-Dimensional High Throughput Screening Approach Identifies Inducers of a Mutant KRAS Selective Lethal Phenotype. Oncogene, 2018, 37: 4372-4384.

7. Structural basis of sterol recognition and non-vesicluar transport by lipid transfer proteins anchored at membrane contact sites. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018 Jan 30;115(5):E856-E865.

8. eIF3 associates with 80S ribosomes to promote translation elongation, mitochondrial homeostasis, and muscle health. Molecular Cell, 2020 Jun 19;S, 1097-2765(20)30388-9.

奖项:

1. 2019年国家科学技术进步二等奖:新型稀缺酶资源研发体系创建及其在医药领域应用,获奖人:陈侠斌(3/10)

2. 2018年教育部科技进步一等奖:新型稀缺酶资源研发体系创建及其在医药领域应用,获奖人:陈侠斌(6/17)

3. 2016年国家优秀留学生奖,获奖人:陈侠斌

4. 2020 / 2021年杭州师范大学医学部青年教师教学技能比赛综合组三等奖,获奖人:童骏森

5. 2019年国家科学技术进步二等奖:新型稀缺酶资源研发体系创建及其在医药领域应用,获奖人:侯书荣(9/10)

6. 2018年教育部科技进步一等奖:新型稀缺酶资源研发体系创建及其在医药领域应用,获奖人:侯书荣(17/17)

7. 2017年和2018年美国实验室自动化和药物筛选年会Tony B. Travel Award 奖,获奖人:侯书荣

8. 2021年杭州师范大学医学部青年教师技能大赛综合组二等奖,获奖人:邱婷

联系方式:

陈侠斌:18701827495 / xch226@hznu.edu.cn

侯书荣:houshurong@hznu.edu.cn

童骏森:junsentong@hznu.edu.cn

邱婷:tingqiu@hznu.edu.cn

林英英:YYLin@hznu.edu.cn

王大明:wdm@hznu.edu.cn